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楼主: zhushengm

r语言依赖包问题

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 楼主| 发表于 2023-9-9 22:03 | 显示全部楼层
85601170 发表于 2023-9-9 21:30
没看懂,是如何出错的?
你发详细过程看,就是安装了连接的三个包?然后怎样出现的错误提示? ...

你好
比如他提示缺少MendelianRandomization
install.packages("MendelianRandomization")
但是提示如图
 楼主| 发表于 2023-9-9 22:03 | 显示全部楼层
如图
截图_2023-09-09_22-24-16.png
发表于 2023-9-10 08:14 | 显示全部楼层
TwoSampleMR这个包是存储在GitHub库里的,所以我们需要使用devtools来安装,具体代码如下:

install.packages(‘devtools’)
devtools::install_github(‘MRCIEU/TwoSampleMR’)
上述代码是用来安装最新TwoSampleMR包的,如果你想使用老版的TwoSampleMR包,只要添加一个版本号即可:

devtools::install_github(‘MRCIEU/TwoSampleMR@0.4.26’)

万事开头难,我身边不少小伙伴在安装TwoSampleMR包时出现问题,米老鼠给大家总结了几点原因以及相关解决办法,可以一试:

(1)出现网络连接不畅的问题,这可能是你频繁地从GitHub上获取数据,或者是GitHub网站那个时候不太稳定,亦或者是你的网络不畅导致的。这时候你先检查自己的网络看看,如果网通畅的话,可以过一会儿再安装亦或是手动安装。

(2)出现某个依赖包安装失败时(比如“MRIntruments“),可以先安装这个依赖包试试,逐步排查问题,在安装过程中不要随便更新其它R包!只有当一个R包不更新便无法导致安装时,再更新这个R包。

(3)如果更新一个R包失败的话,先关闭R环境,然后回到原来R包所在文件夹,手动删除该包后启动R重新安装。


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 楼主| 发表于 2023-9-11 19:57 | 显示全部楼层

谢谢你的留言
我添加后面几个依赖总是安装不上

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